板蓝根是清热解毒的中药，毒副作用小，使用方便，很受一些家庭青睐。对多种细菌性、病毒性疾病，譬如流感、流脑、肺炎、肝炎等，都有着较好的预防与治疗效果。
药理研究表明，板蓝根的功效可明显抑制多种病毒与病菌。
板蓝根对多种细菌有作用。水浸液对枯草杆菌、金黄色葡萄球菌，八联球菌、大肠杆菌、伤寒杆菌、副伤寒甲杆菌、痢疾（志贺氏、弗氏）杆菌、肠炎杆菌等都有抑制作用；丙酮浸出液也有类似作用，且对溶血性链球菌有效（皆用琼脂小孔平板法）。对A型脑膜炎球菌之抑菌作用与大蒜、金银花相似。板蓝根、大青叶抗菌、抗病毒的有效成分，有人认为是靛甙。实验证明，靛甙在体内外皆无抗菌作用；体外抗病毒作用亦不突出；在体内排泄又快，故认为它无明显生理和抗菌的活性作用。其有效成分尚待研究。
提高免疫小鼠腹腔注射板蓝根多糖50mg/kg，可显著促进小鼠免疫功能，表现为：能显著增加正常小鼠脾重。白细胞总数及淋巴细胞总数，对氢化可的松所致免疫功能抑制小鼠脾指数、白细胞总数和淋巴细胞数的降低有明显对抗作用；显著增强二硝基氯苯所致正常及环磷醉酰胺所致免疫抑制小鼠的迟发型过敏反应；增强正常小鼠外周血淋巴细胞ANAE阳性百分率，并明显对抗氢化可的松所致的免疫抑制作用；但板蓝根多糖体外实验对刀豆素A诱导的小鼠脾细胞淋转反应无明显增强作用，。此外，板蓝根多糖还能明显增强抗体形成细胞功能，增强小鼠静脉注射碳粒廓清速率。
尽管板蓝根对一些常见病有较好的预防作用，但过犹不及，作为一种药品，也有一定的毒副作用。在人体的肝脏解毒能力下降时，仍长时间大剂量服用板蓝根的话，会造成蓄积中毒，伤害人的消化系统与造血系统，容易造成上呼吸道出血、白细胞减少等，这样的病症在幼儿中尤为常见。这是因为幼儿的各种器官尚未发育完全，肝脏功能尚不完善，体内分泌的解毒酶不足。
板蓝根属于性寒之药，对于预防、治疗实热之症有较好疗效，但是对于那些脾胃虚寒的儿童来说，经常服用板蓝根，会致使他们出现口淡、疲劳等症状，造成体质下降，不仅起不到防病的目的，反而会致病。
经常服用板蓝根预防疾病并不科学[52石斛网www.52shihu.com]，它可能会造成人体免疫功能的下降，尤其是对于幼儿来说，常服板蓝根有时不仅起不到预防疾病的效果，甚至会对孩子的消化系统和造血系统造成伤害。