两者的科属不同，海鸥是鸥形目鸥科，海燕是鹱形目海燕科。
体型不同，海燕小，海鸥大。
外观不同，海燕翅短而圆，海鸥翼长而尖，体羽多灰、白色，有的种类羽毛还带有黑色部分。
海燕：
简介：
是鹱形目海燕科鸟类的统称，小型鹱类，也是体型最小的海洋鸟类，翅短而圆，飞行时振翼频率高，以不惧怕惊涛骇浪而著称。事实上，鹱形目的鸟类都是利用气流的高手，经常借助狂风的力量飞翔。海燕有8属约20种在太平洋地区种类最多，大西洋地区种类较少，印度洋北部则没有分布。我国有2属4种。
外形特征：
南部海洋繁殖的大多数种类，短翅，方形尾，长脚，短趾。捕食小型海洋生物时两翅张开，劈拍地飞过水面，例如黄蹼洋海燕，在沿南极大陆和南极圈附近小岛上繁殖，6~9月在北大西洋越冬。
北方的大多数种类翅较长，尾叉形或楔形，脚短而趾长;觅食时，像小海鸥一样自水面掠过，偶尔降落水面。例如白腰叉尾海燕，在北大西洋繁殖，也繁殖于太平洋岛上南至北纬28°左右。其他几种叉尾燕见于太平洋北部。
海鸥：
简介：
是鸥形目鸥科鸟类的统称，海洋鸟类，体型大小有差别，翼长而尖，善于飞行，体羽多灰、白色，有的种类羽毛还带有黑色部分，冬季和夏季羽毛稍有区别。海鸥广布全球海洋，种类多，主食为鱼类和各种水生动物。常见有：银鸥灰头鸥、红嘴巨鸥。
形态特征：
海鸥海鸥成鸟夏羽：头、颈白色，背、肩石板灰色；翅上覆羽亦为石板灰色，与背同色；腰、尾上覆羽和尾羽均为纯白色。第1、2枚初级飞羽黑色而具较大的白色次端斑，基部灰白色或在内翈形成较大形的灰色斑；其余初级飞羽灰色，由外向内各羽具由宽变窄的黑色次端斑及由小变大的白色端斑；内侧初级飞羽的黑色次端斑消失，仅存白色端斑；次级飞羽和三级飞羽为石板灰色而具宽阔的白色端斑。下体纯白色。
成鸟冬羽：与夏羽相似，唯头顶、头侧、枕和后颈具淡褐色点斑，点斑在枕部有时排列呈纵行条纹，在后颈排列呈横纹。
幼鸟：上体大致呈白色，具淡褐色横纹状斑点；尾上覆羽白而具褐色横斑，尾灰褐色，基部白色；初级飞羽黑褐色，其他飞羽褐色而具淡白色边缘。亚成鸟尾羽白而具宽阔的黑色次端斑，次级和三级飞羽淡灰色而具褐色块斑。
虹膜黄色；嘴、脚和趾浅绿黄色；幼鸟虹膜褐色，嘴粉红色或淡褐色，与成鸟冬季相似，均具黑色次端斑；脚呈肉色。