不一样。区别如下：
1、产地不同
胡麻籽油：
胡麻只适宜生长在寒冷地区，胡麻原产于地中海地区，汉代传入中国西北少数民族地区，因为其独特的习性，所以无法在热带地区生长。传统的胡麻，在中国，主要分布在甘肃定西市周边地区、山西北部大同地区，河北北部、宁夏、内蒙古、新疆等地种植。
亚麻籽油：
油用亚麻主要产于加拿大、中国、阿根廷、美国。我国是在公元前2世纪由汉代特使张骞出使西域时带回的亚麻种子。
在新疆，甘肃，宁夏、黑龙江、吉林、内蒙古、山西、东北等地开始种植，初始亚麻籽主要作药用，直到16世纪才用其种子榨油，如今是我国主要经济作物之一。
也是我国华北、西北、东北高寒地区种植的主要油料作物。我国东北纬度高与加拿大纬度相近，所产亚麻籽最适合工业生产用亚麻油。
2、营养价值不同
胡麻籽油：
胡麻籽中含有6%～10%的胡麻胶。胡麻胶是一种以多糖为主的果胶类物质，含有12%的蛋白质，17%左右的果胶酸、淀粉、矿物质等，可当做食品添加剂、化妆品原粉、医药原料等。
每100克亚麻籽油所含营养素如下：热量(900.00千卡)、脂肪(100.00克)、维生素E(389.90毫克)、钙(3.00毫克)、磷(5.00毫克)、钠(0.60毫克)、镁(1.00毫克)、铁(0.20毫克)、锌(0.30毫克)、铜(0.02毫克)、锰(0.03毫克)。（胡麻籽油）
亚麻籽油：
亚麻籽中粗蛋白、脂肪、总糖含量之和高达84.07%。亚麻籽蛋白质中氨基酸种类齐全，必需氨基酸含量高达5.16%，是一种营养价值较高的植物蛋白质。
亚麻籽油中α-亚麻酸含量为53%，α-亚麻酸是人体必需脂肪酸，在人体内可转化为二十碳五烯酸和二十二碳六烯酸，它们为鱼油中的有效活性成分。
α-亚麻酸有抗肿瘤，抗血栓，降血脂，营养脑细胞，调节植物神经等作用，受到较多的关注。亚麻籽中含有大量多糖，多糖有抗肿瘤，抗病毒，抗血栓，降血脂的作用。(亚麻籽油)
3、功效不同
胡麻籽油：
大量的研究结果表明，亚麻籽油是一种优质食用油，富含α一亚麻酸及各种不饱和脂肪酸，在人体内可直接转化成DHA和EPA。亚麻籽油中含48%的亚麻酸，这是植物油中最高的，是一种经济实用的“深海鱼油”。
“鱼油”指EPA和DHA，是由海里的α-亚麻酸（主要含在海藻中）在鱼的体内变成的。人服用α-亚麻酸（主要含在胡麻油中），在体内也会合成EPA和DHA。
所以食用富含a-亚麻酸的亚麻籽油，就可以起到类似吃“鱼油”的效果；修复更新脑神经细胞膜的不饱和脂肪酸链，起到健脑、促智、降血脂、抗血小板聚集、扩张小动脉和预防血栓形成等。
亚麻籽油：
经研究和临床实验，证实亚麻籽油有以下功用：
1.肌肤娇柔亮泽
改善皮肤脂肪含量，使肌肤更幼滑、滋润、柔软有弹性，同时令皮肤呼吸及排汗正常，减轻种种皮肤问题。
2.减肥
可消耗身体多余脂肪，是健康减肥法。
3.改善女性经前综合症
有许多女性经前综合症的例子，例如痛经等，症状都在每天吃了新鲜的亚麻籽油后完全消失，当然需要配合维他命及矿物质。
4.提升抗压力
欧米伽3可减少身体受压力时所产生的有害生化学物质的影响，稳定情绪，保持平静心态，减少忧郁症及失眠症。
百度百科-亚麻籽油
百度百科-胡麻油
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