区别如下：
1、体型特征不同：武昌鱼，体高而侧扁，体长165～456毫米，为体高的2.1~2.2倍。体呈青灰色，体侧鳞片基部浅色，两侧灰黑色，在体侧形成数行深浅相交的纵纹。鳍呈灰黑色。体侧扁而高，呈菱形，背部较厚，自头后至背鳍起点呈圆弧形，腹部在腹鳍起点至肛门具腹棱，尾柄宽短。
鳊鱼体高，侧扁，全体呈菱形，体长约50厘米，为体高的2.2—2.8倍。体背部青灰色，两侧银灰色，腹部银白；体侧鳞片基部灰白色，边缘灰黑色，形成灰白相间的条纹。体侧扁而高，呈菱形。头较小，头后背部急剧隆起。眶上骨小而薄，呈三角形。口小，前位，口裂广弧形。上下颌角质不发达。背鳍具硬刺，刺短于头长；胸鳍较短，达到或仅达腹鳍基部，雄鱼第一根胸鳍条肥厚，略呈波浪形弯曲；臀鳍基部长，具27—32枚分枝鳍条。腹棱完全，尾柄短而高。鳔3室，中室最大，后室小。
2、鱼刺数量不同：武昌鱼有13根半鱼刺，鳊鱼有13根鱼刺。
鳊鱼主要价值
1、药用：鳊鱼具有补虚，益脾，养血，祛风，健胃之功效，可以预防贫血症、低血糖、高血压和动脉血管硬化等疾病。
2、适用人群：一般人都可食用，适宜贫血，体虚，营养不良，不思饮食之人食用；
3、文献记载：唐、孟诜：患疳痢者不得食。《食疗本草》：鲂鱼[52石斛网www.52shihu.com]，凋胃气，利五脏，和芥子酱食之，能助肺气，去胃风，消谷。作鲒食之，助脾气，令人能食，作羹膳食宜人，功与鲫同。凡患有慢性痢疾之人忌食。
4、营养：肉鲜美，质鲜嫩而含脂量高，内脏含脂量更大。每一百克含蛋白质21.0毫克，脂肪6.9-8.0克，热量92千卡，钙120毫克，磷165毫克，铁1.1毫克。