（1）在肥水上的应用：腐植酸钠最早在水产上的应用就是源于其肥料的属性，但并不是养分的原因。近两年有人提出其可以补充水体碳源，如果从这个角度上来谈，是有一定道理的，因为腐植酸钠是腐植酸的钠盐，腐植酸是一类高分子有机弱酸，是植物残体腐解后形成的产物，主要由碳、氢、氧、氮等元素组成。
据资料显示，腐植酸元素组成大致是碳占50%-60%、氢占4%-6%、氮占1.5%-6.0%，其余元素大部分是氧。此外，还含有1%以下的硫和磷。因此把其做为水体碳源的补充是可以讲得通的[52石斛网www.52shihu.com]，但补充碳源到底对肥水产生了什么样的影响，目前暂未有相关研究。
（2）净化水质：因为腐植酸钠是一种比较稳定的具有芳香结构的天然大分子有机质，由稀疏的芳香环连结一起构成的一张断断续续的网，结构中有许多大小不一的空洞孔隙。由于其具有复杂的结构和多种功能团，因而具有很高的反应活性和较强的吸附性能。
所以其在实际应用中可以达到净化水质的效果，但实际的反馈效果来看，粉状产品比片状产品来得要快些，主要的原因可能是粉状产品在水中的沉降速度比片状产品来得快有关。同时净化水质的效果可能还有一个方面，一是多孔结构为有益生物提供了良好的繁殖场所；二是腐植酸钠本身可以释放初生态氧，从而对某些细菌的生长有抑制作用。