【药理作用】①抗微生物及抗原虫作用
一细菌：体外试验证明，黄连或小檗碱对溶血性链球菌、脑膜炎球菌、肺炎双球菌、霍乱弧菌、炭疽杆菌以及金黄色葡萄球菌皆有较强的抑菌作用；对痢疾杆菌、白喉杆菌、枯草杆菌、绿色链球菌均有抑制作用；对肺炎杆菌、百日咳杆菌、鼠疫杆菌、布氏杆菌、破伤风杆菌、产气荚膜杆菌、结核杆菌等亦有效；对变形杆菌、大肠杆菌、伤寒杆菌则作用较差，对宋内氏痢疾杆菌，副伤寒杆菌、绿脓杆菌则几无作用。由于实验方法之不同，各家报告有些差异。对痢疾杆菌，以舒氏痢疾杆菌的敏感度较高，其次弗氏、宋内氏最差。其作用等于或优于磺胺而弱于链霉素及氯霉素。黄连粗提取物与纯小檗碱的抗菌作用，基本上是一致的；但也有少数情况，对某种细菌的作用不完全一致的。煎剂即有良好的抗菌作用，对链霉素、氯霉素、土霉素抗药后，小檗碱仍有抗菌作用，也有报告，加用小檗碱可恢复肠道细菌对上述药物的敏感性；在体外及体内的试验中，它与链霉素、磺胺对葡萄球菌还显示有协同作用。小檗碱与磺胺类药物对痢疾杆菌同时发生抗药性的菌株虽较多，但并无完全的交叉耐药性。在试管中对百日咳杆菌有显著的抑菌作用，虽然其最低有效浓度高于链霉素与氯霉素，但其临床疗效至少不低于链霉素与氯霉素。对白喉杆菌，体外有抑菌作用；但口服黄连，不能保护白喉杆菌对豚鼠的致死作用，也未能减轻或抑制局部反应的发生以及皮内注射白喉毒素的局部反应。对鸟型、牛型、人型结核杆菌皆有抑制作用。由于所用培养基及菌株等条件的不同，其抑制作用有较为显著的，也有不显著的，一般远不及对氨水杨酸。体内试验，对接种结核杆菌的小鼠、家兔、豚鼠的疗效均不十分显著。有人报告，1：2000小檗碱与结核菌在体外作用三日后，并不影响细菌对豚鼠的致病力，如作用14日后，则可使其致病力降低1/2。二其他微生物及原虫：在鸡胚试验中，黄连对各型流感病毒、新城病毒均有一定的抑制作用。在试管中对十余种常见致病性真菌有广泛而显著的抑制。对钩端螺旋体，在试管中有相当强的杀灭作用，小檗碱在7。5微克/毫升，黄连水煎剂在1。9毫克/毫升时，即有显著作用。黄连煎剂及硫酸小檗碱在体外及体内均有抗阿米巴原虫作用，体外试验，其效力相当于依米丁的1/128，汉防己甲素的1/4；体内试验相当于汉防己甲素的1/16。此外，尚有抗滴虫、抗黑热病原虫、抗锥虫、杀草履虫等作用。由于其作用广泛，有人认为可作为防腐剂，其酚系数在5～20之间。黄连抑菌的有效成分，一般认为是小檗碱。
②对循环系统的作用
静脉注射或口服小檗碱对麻醉(犬、猫、兔)或不麻醉(大鼠)动物，均可引起血压下降。
③对乙酰胆碱等的作用
小檗碱在哺乳类心脏标本(心肺装置、离体猫心、离体兔心耳、离体猫心耳)上，小剂量能增强乙酰胆碱的作用，大剂量则对抗之，在整体动物上也是这样，小剂量增强乙酰胆碱或电刺激迷走神经外周端引起的血压下降，大剂量则削弱此种反应。在兔耳、蛙下肢灌流、离体兔肠、支气管等标本上，小檗碱都能增强乙酰胆碱的作用；亦可增强电刺激鼓索神经、注射毛果芸香碱引起的唾液分泌。在对家兔瞳孔的试验中，局部用药，小檗碱(0。5%)可增强乙酰胆碱的作用。此外，它还能显著增强乙酰胆碱对蛙腹直肌的作用，小剂量时呈现显著的抗箭毒样作用，剂量过大，则又可增强某些药的箭毒样作用。在整体动物身上也可观察到抗箭毒样作用，但在体内，作用发生很慢，与毒扁豆碱不同。其作用强度(兔垂头及小鼠的毒性试验)不如毒扁豆碱，其衍化物可有更强的抗箭毒样作用。总之，小檗碱具有双相作用；
④对平滑肌的作用
小檗碱除对血管平滑肌起松弛作用外，对其他平滑肌如子宫、膀胱、支气管、肠胃道等都具有兴奋作用。对离体豚鼠及猫的子宫有显著的兴奋作用，甚至超过北美黄连碱，此点在妇产科应用上有意义。黄连煎剂对离体兔肠，低浓度使肠的紧张度上升，浓度过高反引起弛缓。
⑤对胆汁分泌及血液的影响
小檗碱有利胆作用，增加胆汁形成，使胆汁变稀，对慢性胆囊炎患者，口服有良好效果。在慢性试验中，小檗碱对大鼠口服(20毫克/公斤)、肌肉注射(2毫克/公斤)可降低血清胆甾醇。黄连的热水浸液对家兔在饲喂胆甾醇或切除甲状腺后，可使升高的血清C/P值较早的恢复正常或降低血脂质水平。对家兔的苯肼性动脉硬化症，三黄粉(黄连、黄芩、大黄)可使升高的c/P值有所下降。早年报告的降低血糖的作用，未被证实。据报道，小檗碱及某些苦味健胃药(丁香中的石竹萜烯等)有抗贫血作用。对注射苯肼及二胺甲苯引起贫血的家兔，小檗碱可使红细胞的减少幅度较对照组少而血红蛋白也有某些增高。但也有报告，未发现黄连粉末有此作用。早年报告的小檗碱能减少白细胞，抑制白细胞的阿米巴样运动，未被证实，一般剂量时，它对白细胞并无影响。
⑥抗癌、抗放射及对细胞代谢的作用
以前认为小檗碱系原浆毒或细胞分裂毒，它与秋水恼、白屈菜碱同属芪胺类化合物，并与秋水仙有协同作用。在组织培养试验中，抑制细胞呼吸、氧的摄取并引起细胞的脂肪性变，萤光照相显示小檗碱存在于细胞内之颗粒中。它的抑制细胞呼吸，主要是由于抑制了丙酮酸的氧化脱羧所致，对异丁烯二酸、延胡索酸、醋酸、无氧糖醇解等并无影响。也有认为，它之抑制呼吸，主要是抑制黄酶，而癌组织的黄酶含量低，故较正常细胞对小檗碱更为敏感，还有报告它能抑制癌细胞的核酸合成，抑制嘌呤核甙酸合成的中间体羧胺的利用。尽管在试管中有制癌作用，但对小鼠艾氏腹水癌的治疗作用效果不佳。小檗碱对小鼠遭受Coγ-射线照射而致的死亡有某些保护作用，从体外酵母菌的试验中得知，此种保护可能与小檗碱改变了细胞内微粒体表面的某些特性有关。
⑦其他作用
小檗碱小剂量能加强小鼠大脑皮层的兴奋过程，大剂量可削弱之；同时它也能加强抑制过程。小檗碱对颈动脉体、骨髓及肠管的化学感受器有兴奋作用；颈动脉注射与静脉注射本药不同，不是引起恒定的降压反应，而是引起血压的波动性改变。此种现象可能与它对颈动脉体的反射性升压作用这一因素有关。在对大鼠的巴豆油肉芽囊的实验中，用组织学的方法证明，小檗碱皮下注射，可帮助机体加强对炎症病灶形成屏障的作用。黄连的甲醇提取液有抗炎作用(大鼠足踝浮肿法及巴豆油肉芽囊性炎症法等)，局部给药也能使肉芽肿重量减轻，其作用近似保泰松。据称小檗碱有解热、抗利尿、局部麻醉、镇静、镇痛、延长戊巴比妥睡眠时间以及降低家兔眼内压等作用，无雌性激素样作用。黄连与萱草根同时或在较短时间内同服，可降低后者对小鼠的毒性。
⑧吸收、分布、排泄
小檗碱口服不易吸收。肠外给药，吸收入血后迅速进入组织，血浓度不易维持；人类口服0。4克盐酸小檗碱后30分钟血浓度为100微克%(体外杀菌浓度大约为20毫克%)，随后逐渐减少，即使重复给药，每4小时0。4克，血浓度亦不见增高。在体内，几乎所有组织均有小檗碱的分布，而以心、肾、肺、肝等为最多。它在各组织中贮留的时间甚为短暂，24小时后仅有微量，主要在体内进行代谢，也有少部分(6。4%)经肾排出。兔口服后，亦能吸收，并能在血中停留72小时，尿中亦有排泄，组织中以心脏中浓度最高，胰、肝次之。大鼠口服，吸收甚微。注射给药，则主要进入心、胰、肝、大网膜脂肪；24小时后仅有胰、脂肪中中仍可查见相当量的小檗碱。仅少量(1%)自尿排出。