最早对芥蓝进行分类学研究的是（1922）。他把芥蓝开白花作为主要特征之一，与开黄花的其他甘蓝类植物相区别而把芥蓝定为十字花科、芸薹属的一个种（）。后来的分类学者对芥蓝的认识和描述多以（1922；1930）的研究为依据。此后，（1927）发现芥蓝与甘蓝杂交极为容易，于是提出芥蓝是甘蓝的一个变种，并得到一些学者的承认。1956年，把芥蓝归属为十字花科、芸薹属、甘蓝种的一个变种（var.），并得到了很多研究的支持。
1987年出版的《中国植物志》认为芥蓝的植物学分类地位尚无定论。杨萍等（1988）发现，芥蓝与结球甘蓝等染色体核型存在一定的差异，芥蓝的花粉形态与羽衣甘蓝、白叶苤蓝的形态差异很大。刘海涛、关佩聪（1998）研究发现，芥蓝与原产中国的萝卜的属间杂交结实率（5.6%）高于原产欧洲的结球甘蓝与萝卜的属间杂交结实率（0），芥蓝为一年生或二年生，而甘蓝类其他蔬菜多属二年生；芥蓝开白花或黄花，而甘蓝类其他蔬菜开黄花；芥蓝种子的3-丁烯基异硫氰酸盐与丙烯基异硫氰酸盐的相对比值与甘蓝类其他蔬菜有很大差异。并从形态地理学的角度提出：把芥蓝定为芸薹属的一个独立种比定为甘蓝的一个变种更为合理，并对甘蓝类蔬菜的检索表进行了修订。
甘蓝类蔬菜检索表
实际上，芥蓝不仅有开白花（称为白花芥蓝），还有开黄花的（称为黄花芥蓝），且都是一年生或二年生（中国科学院华南植物研究所，1956；辞海编辑委员会[52石斛网www.52shihu.com]，1980）。两者的其他形态特征相同（刘海涛等，1997）。
刘海涛和关佩聪（1998）的研究一方面支持的分类，同时很多结果又支持的分类。他们的研究表明，芥蓝干种子和幼苗茎的过氧化物酶同工酶酶谱上的酶带在甘蓝类其他蔬菜的酶谱上都出现过，而且像芥蓝与结球甘蓝那样只是在酶带宽度和颜色上有些不同。这些说明了芥蓝与甘蓝类其他蔬菜有着密切的亲缘关系。而且，芥蓝与结球甘蓝、花椰菜、青花菜的杂交结果率达到82.9%～97.2%。刘海涛等（1997）的另一项研究结果表明，不论白花芥蓝还是黄花芥蓝，其花粉主要形态特征与甘蓝类其他蔬菜基本相同。王晓蕙等（1987）的研究发现，芥蓝与结球甘蓝具有统一的染色体组型公式及十分一致的显带类型，并据此支持芥蓝是甘蓝变种的观点。何丽烂等（2005）采用芥蓝2个品种、甘蓝种下9个变种的栽培品种，共计11个品种的叶、根进行POD和PPO酶带比较和聚类分析研究，结果说明，芥蓝归列为甘蓝种下1个变种是合理的。等（1976）对甘蓝类蔬菜种子蛋白质进行了研究，其结果不支持芥蓝是一个独立的种。由上可见，有关芥蓝的植物学分类地位，仍有待进一步的深入研究。