去不去皮都可以，只是在口感上去皮的冬瓜吃起来能鲜嫩一些，现在菜的种植都打农药，还是把皮去掉吧。
冬瓜皮的功效与作用：
【性味】
味甘；性微寒。
《滇南本草》：性微寒平，味甘淡。
《本草再新》：味甘，性凉，无毒。
【归经】
归脾、小肠经。
《滇南本草》：入脾、肺二经。
【功效主治】
清热利水；消肿。主水肿；小便不利；泄泻；疮肿。利尿消肿。用于水肿胀满，小便不利，暑热口渴，小便短赤。《本草图经》：功用与冬瓜等。《纲目》：主驴马汗入疮肿痛，阴干为末涂之，又主折伤损痛。《滇南本草》：止渴，消痰，利小便。治中风。《本草再新》：走皮肤，去湿追风，补脾泻火。《山东中药》：利湿消暑。《重庆堂随笔》：解风热，消浮肿。《分类草药性》：治水肿，痔疮。《江苏植药态》：治腹泻、足跗浮肿。
水肿
本品味甘，药性平和，善于利水消肿。用于治水肿，如《湖南药物志》以本品配五加皮、姜皮，煎服；若治体虚浮肿，如（《浙江药用植物志》）用冬瓜皮、赤小豆、红糖适量。煮烂，食豆服汤。
暑热证
本品性凉，有清热解暑的作用。用于治夏日暑热口渴，小便短赤，如（《四川中药志》）冬瓜皮、西瓜皮等量，煎水代茶饮；若治暑湿证，可与生薏苡仁、滑石、扁豆花等同用。
清热止咳
用于痰热内阻咳嗽，常与清热化痰药同用。
利湿排脓
用于肺痈，常与芦根、薏苡仁、黄芩等同用。
用于肠痈，常与大黄、丹皮、桃仁、冬葵子同用。
抗菌作用
利水渗湿药[52石斛网www.52shihu.com]，特别是利尿通淋药，经体外抗菌试验，有不同程度的抗菌作用，茵陈对结核杆菌及球菌等有抑制作用。扁蓄浸出液对某些真菌有抑制作用，对细菌的抑制作用较弱，泽泻能抑制结核杆菌的生长，木通水煎剂及半边莲对多种致病真菌也有不同程度的抑制作用。地肤子水浸剂在试管内对许兰氏黄癣菌、粤杜盎氏小芽胞癣菌等皮肤真菌有抑制作用。