1、味道不同
1）大多数情况下，圆的比较粉。
2）大多数情况下，长的比较甜。
2、肉质不同
1）长形的肉质稍微松散，煮粥或蒸着吃很好，适合老人吃，也可以做婴幼儿辅食。
2）而扁圆形的南瓜肉质紧密，其果胶含量多于长形，有很好的饱腹感。
3、外观不同
1）圆南瓜的外形，扁形或不规则的葫芦形，皮肤上通常有几个纵向凹槽。
2）长南瓜形状类似长棒槌形，皮肤光滑或有纵向凹槽。
南瓜的主要价值：
1、多糖类：南瓜多糖是一种非特异性免疫增强剂，能提高机体免疫功能，促进细胞因子生成，通过活化补体等途径对免疫系统发挥多方面的调节功能。
2、类胡萝卜素：南瓜中丰富的类胡萝卜素在机体内可转化成具有重要生理功能的维生素A，从而对上皮组织的生长分化、维持正常视觉、促进骨骼的发育具有重要生理功能。
3、果胶：南瓜中的果胶能调节胃内食物的吸收速率，使糖类吸收减慢，可溶性纤维素能推迟胃内食物的排空，控制饭后血糖上升。果胶还能和体内多余的胆固醇结合在一起，使胆固醇吸收减少，血胆固醇浓度下降。
4、矿质元素：南瓜含有丰富的钴，在各类蔬菜中含钴量居首位。钴能活跃人体的新陈代谢，促进造血功能，并参与人体内维生素B12的合成，是人体胰岛细胞所必须的微量元素。南瓜中所含的维生素C能防止硝酸盐在消化道中转变成致癌物质亚硝酸。
5、氨基酸：南瓜中含有人体所需的多种氨基酸，其中赖氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸等含量较高。此外，南瓜中的抗坏血酸氧化酶基因型与烟草中相同，但活性明显高于烟草，表明了在南瓜中免疫活性蛋白的含量较高。