丝瓜枯萎病会导致丝瓜藤不长，苗期发病，子叶先变黄、萎蔫后全株枯死，茎部或茎基部变褐缢缩成立枯状。成株发病主要发生在开花结瓜后，初表现为部分叶片或植株的一侧叶片，中午萎蔫下垂，似缺水状，但萎蔫叶早晚恢复，后萎蔫叶片不断增多，逐渐遍及全株，致整株枯死。主蔓基部纵裂，纵切病茎可见维管束变褐。湿度大时，病部表面现白色或粉红色霉状物，即病原菌子实体。有时病部溢出少许琥珀色胶质物。
防治方法
(1)选用抗（耐）病品种和早熟品种。
(2)与非瓜类作物进行5年以上轮作。
(3)施用酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟的有机肥或在土壤中添加0.5%的s—H添加剂（稻壳、蔗渣、虾壳粉等加尿素、过磷酸钙、硝酸钾制成），可减少枯萎病发生。对酸性土壤应施用消石灰，每667平方米/100～150kg把土壤pH调到中性。
(4)种子消毒或包衣。
①浸种种子可用40%福尔马林150倍液浸种30分钟，捞出后用清水冲洗干净再催芽播种；也可用50%甲基硫菌灵或多菌灵可湿性粉剂浸种30～40分钟。
②用种子重量0.2%～0.3%的40%拌种双粉荆或50%多菌灵可湿性粉剂拌种。
③种子包衣。用0.3%～0.5%的种衣剂9号或10号进行包衣。
(5)采用营养钵育苗，移栽时用双多悬浮剂（西瓜重茬剂）300～350倍液灌穴，每穴0.5kg，每667平方米用药1kg；对直播的在播种和丝瓜5～6片真叶时分别灌双多悬浮剂600～700倍液，每穴灌对好的药液0.5kg，每667平方米两次用药1kg。
(6)坐瓜后发病前或发病初期，除采用上述药剂外，还可选用10
苦瓜专用砧木丝瓜新品种蓉砧
%双效灵水剂200倍液或60%防霉宝超微可湿性粉剂600倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液、20%甲基立枯磷乳油1000倍液、12.5%增效多菌灵浓可溶剂200～300倍液、60%琥乙膦铝可湿性粉剂350倍液灌根，每株灌对好的药液100毫升，隔10天再灌一次，连续防治2～3次。对枯萎病一定要早防、早治，否则效果不明显。此外，于定植后开始喷洒液体法生产的细胞分裂素500～600倍液，隔7～10天1次，共喷3～4次，可明显提高抗性，如能加入0.2%磷酸二氢钾或0.5%尿素或喷洒喷施宝每毫升加水11～12升、植宝素7500倍液、惠满丰活性液肥，每667平方米400～500毫升，对水400～500倍液，也可喷洒促丰宝600～800倍液。
(7)丝瓜枯萎病发生重的地区或田块，提倡选用云南黑籽南瓜或南砧1号做砧木，用适合当地的优良丝瓜品种做接穗进行嫁接。嫁接苗对枯萎病防效达90%以上。方法参见西葫芦枯萎病。采用靠接或插接法，进行嫁接后置于塑料棚中保温、保湿，白天控温28℃，夜间15℃，相对湿度90%左右，经半个月成活后，转为正常管理。