当地上部分茎叶完全枯黄时即可采收,时间在10月底至11月初。长江流域在初霜后,即10月下旬至12月上旬,华南地区于12月至次年2月种植前,即从地上部枯黄至次年球茎发芽前均可应市场需要随时采收。但长江流域以12月、华南地区以1月份收获产量最高,因为慈姑地上部叶片经霜冻枯死后,其短缩茎中贮存的养分仍不断地输入球茎,使球茎进一步充实。尤其是留种田,更要适当延迟收获。长江流域以南地区[52石斛网www.52shihu.com],慈姑球茎可在土中安全过冬,故可延至早春采收,但为了增加复种指数,一般多在冬季收完。收获前10~15天排干田水,割去叶片,用齿耙剥去13~17厘米土层,用手挖取。