（一）根
瓠瓜根系较浅，再生能力弱，侧根发达，横向伸展能力较强，一般可达3m左右，部分品种在肥力水平高，通透性好的沙壤土中可伸至4m以外。瓠瓜的下胚轴（子叶以下部分根茎）于土壤中能分生不定根，特别是在老根受损时能产生多条侧根，并起到较好的替代作用。不同品种根的垂直伸展能力也有不同，一般长瓠子根系较浅，主要根群垂直分布在20cm左右，再生能力弱，伤根后不易恢复生长。而圆葫芦根系较深，达25cm以上，抗旱能力较强。但它们的耐涝性都差。
（二）茎
瓠瓜茎蔓生、分枝能力强，特别是当主茎受损后会很快产生多条侧蔓，当侧蔓顶部受损后，在肥水供应充足的情况下又可在侧蔓上分生孙蔓……。茎蔓横断面呈五棱形，表皮上分生细刺毛。瓠瓜子叶以上的1～5叶节节间特别短，是主茎由直立性转向匍匐之前的节位，其中尤以第三至第五节间出现的侧蔓生长优势最强。
瓠瓜茎蔓的节间长度因品种和栽培条件不同而异，但每个节上都有一个花原基，根原基，侧枝原基和苞叶原基；如进行爬地栽培，其接触地面或接近地面的茎节能产生1～3条不定根，有很强的吸肥、吸水能力。
（三）叶
瓠瓜叶面大而薄，单叶互生，心脏形或肾形，不分裂或稍浅裂，叶缘有小齿，叶柄长，顶端具两个腺体，叶面有茸毛。基部几片叶较小，多数品种叶全缘，俗称板叶。以后随蔓的伸展叶面积增大，出现本品种的固有形态，其叶片的大小、叶柄的长度因品种不同而异。
瓠瓜为喜光作物，在弱光照条件下节间和叶柄将迅速伸长。瓠瓜叶片的蒸腾量大，对肥水要求高，如肥水不能满足，会导致畸形瓜增多。
（四）花
瓠瓜花白色、单生，花梗长；雄花花托漏斗状，长约2cm，花萼裂片披针形，长3mm左右，花冠裂片皱波形，披柔毛或黏毛，长3～4cm，宽2～3cm，雄蕊3枚，药室不规则折曲；雌花花萼和花冠似雄花。雌雄异花同株，虫媒花，异花授粉。雄花、雌花均在傍晚开始逐渐开放，第二天8、9时花冠凋萎，雌蕊、花粉也失去生活力，“夜开花”之称由此而来。其绝大多数品种侧蔓着生雌花早于主蔓，侧蔓除着生雌花外也可着生雄花。不同品种雌花出现的时间、节位、数目、雌雄花比例差异显著。一般雄花的发生早于雌花，其花芽的分化和发育随着瓜蔓的伸展由低节位向高节位顺序推进，有时雌花也可能早于雄花2～3d出现，但第一朵雌花由于植株营养面积过小而大多为无效花，没有保留的价值。当瓠瓜开花进入盛花期后，在不整枝情况下会出现2～3朵雌花同时开放的现象。
五）果实
瓠瓜雌花在受精后第二天子房（幼果）开始伸长增粗，但以伸长为主，果柄也相应伸长。雌花在受精后并不是都能发育或发育成理想的商品瓜，这与雌花的质量，受精时植株叶片数、叶面积大小、肥力供应情况、根系的吸收能力以及当时的气候条件密切相关。同时还与开始发育的幼瓜数密切相关，一般能同时正常膨大的幼果数为2个，其余的幼瓜都会在受精后1～2d内停止发育。
瓠瓜幼瓜发育较快，多数品种开花后10～15d即可食用。成熟瓜的瓜形大体可根据雌花子房形态来确定，因此在生产上可充分利用其雌花多的特性，及早去除不符合要求或子房畸形的雌花。
瓠瓜瓜形因品种不同而异，有长圆柱、短圆柱，筒状、棒槌状，直或稍弯曲（瓠子），有圆形、长颈形（葫芦），还有中间缢细、下部和上部膨大（细腰葫芦）或中间缢细、下部大于上部的葫芦形（观赏葫芦）等。瓠瓜嫩瓜瓜面具有白色茸毛，茸毛的疏密与品种有关。果皮有白色、浅绿色、绿色等，且与栽培时的受光量有关，一般背光面颜色较浅，而爬地栽培的着地面多为黄白色。瓠瓜果肉均为白色，单瓜重0.2～4kg，老熟瓜不堪食用。
（六）种子
瓠瓜坐果后40d左右进入老熟期，茸毛渐退，果皮转白色或黄褐色，果实大小基本定型，果壳日趋坚硬；50d后多数留种瓜种子达到生理成熟，种瓜采摘后需经1～2周的堆放后熟，种子才能完全成熟。种子成熟的时间与品种及其果实发育期间气温有密切关系。
瓠瓜种子扁平，但形态差异较大，有卵圆形、纺锤形、尖三角形等。长瓠子类种子外壳有毛，葫芦类种子无毛或稀少且短，多数品种发芽孔上方有两对对称的突出点。种子上毛的多少、有无、种子色泽与种瓜后熟的堆放时间也有关；未充分堆放后熟的长瓠子种子也可能无毛，色浅；堆放时间过长的葫芦类种子也会出现较多的毛。正常种子的种仁（子叶）应为白色。瓠瓜的种子大小因品种等的不同而有较大差异，一般千粒重约125g左右（《浙江效益农业百科全书——瓠瓜》，1999）。
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