（一）灵芝分野生灵芝和人工栽培灵芝两种。野生灵芝多为褐黑色，有光泽。栽培灵芝为棕色实体。
野生灵芝作为珍稀名贵药材，资源十分有限，价格一般较高，而人工栽培的要便宜得多。目前，国内能够规模栽培的灵芝只有赤芝和紫芝两种，其他品种还无法栽培。那么，如何判断买到的灵芝是野生的还是栽培的呢？
下面介绍山野生灵芝与种植灵芝的鉴别，简单易行的鉴别方法是用手和用眼：
用手。直接按灵芝表面，如果很轻易地能够按进去，那就是人工栽培灵芝。因为人工栽培的灵芝生长期短，子实体质地比较松；而野生灵芝长期在野外生长，质地很硬，一般用手是按不进去的。野生灵芝茎比较光滑，手触摸起来感觉就象涂了光油一样油滑，假的灵芝，也就是种植的灵芝，茎比较粗糙，用眼。野生灵芝野外生长环境不尽相同，因此每一个灵芝的差异比较大，表面不光滑，看上去又黑又老；而人工栽培灵芝由于生长环境相同，每个灵芝长得都差不多，表面光亮，故一看就知是温室里培养出来的“花朵”。直径8公分的野生灵芝，茎一般长4寸左右，种植灵芝茎比较短（这些需要有经验的人才能知道），野生的灵芝根部往往沾泥，或是沾黑色的腐木根。8公分以下（小朵）的野生灵芝，菌面边缘通常呈黄色环形（那是因为生长期还没足就被摘下来了），中间深黑色，有亮泽；8公分以上的野生灵芝，全朵菌面呈黑色（因为已足够老了）。种植的灵芝根部是没有沾泥或腐木根的，商贩常把根部剪掉，因为种植的灵芝是在伐倒的野木上凿一个孔，然后才把灵芝子种进去，所以，长大后摘下来的灵芝是不沾泥也不沾有腐木的（当然，有些人为了整洁美观好看，也常把野生灵芝的根部剪掉）。此外，种植的灵芝，8公分以上的，边缘也常有一轮黄色（中间呈黑色），而野生的则没有这种现象。
此外，野生灵芝炖汤，汤味鲜美，有种清香甘甜味道。（其他地方有说灵芝不能炖鸡[52石斛网www.52shihu.com]，会苦，而金秀大瑶山灵芝没有这种现象，苦的反而说明灵芝假、差）。有些无良商贩也常用野生灵芝蒸过一次或二次后，再拿来出售，这样的灵芝，营养大打折扣甚至没有营养。对于蒸过的灵芝与未蒸过的灵芝的鉴别：蒸过的野生灵芝表面看与一般野生灵芝无异，但仔细观察，可发现茎或菌面比较油腻，触摸手指有种“沾”的感觉，有点油的感觉。再者，蒸过的灵芝，表面都比较干净，而且比较旧没有光泽，而未蒸过的野生灵芝，则表面通常都沾有泥尘，比较有光泽，手触摸光滑，无沾粘感。
由于不停采摘，野生灵芝逐年减少，野生灵芝有但量较少，市场上绝大都是种植的。野生灵芝其实与种植灵芝很好分别。依照目前农业科技的水平，人工培植的灵芝，无论在菌种选择上，生长环境的条件控制上，以及掌握最佳打收时间都是科学和安全的。不要把灵芝神化。
（二）对于成朵形的原木灵芝子实体，一般可以从形体、色泽、厚薄、比重上判定其好坏。好的原木灵芝子实体，其朵形呈圆形或肾形，柄短，肉厚，其菌盖的背部或底部，也就是用放大镜能看到有管孔的部位，一般呈淡黄色或金黄色为最佳，呈白色则其次，呈灰白色，而且管孔已经较大的则最次。这种灵芝子实体已经喷射完孢子粉，也就是其营养已经大量转化为孢子粉喷射出，其药力也较差。
（三）要区别是袋栽灵芝还是原木灵芝主要通过以下三种方法，一是袋栽灵芝比重较轻，二是袋栽灵芝菌柄较长，三是袋栽灵芝菌盖背面颜色较浅，一般均呈白色，少见淡黄及金黄色。
（四）野生灵芝在幼嫩时被虫蛀过，会使许多其它多孔菌混杂其中，不仅没营养，而且有害，应注意剔除。