主要区别有，科目类别不同、形态特征不同、生境与分布不同，具体如下：
一、科目分类不同
1、海带
海带，又名纶布、昆布、江白菜，属于褐藻门、不等世代纲、海带目、海带科、海带属。
2、螺旋藻
螺旋藻，属于蓝藻门、蓝藻纲、颤藻科、螺旋藻属。
二、形态特征不同
1、海带
海带的藻体褐色，革质，单条，片状，不分枝，高2～5米，宽20～30厘米。固着器为数次叉状分枝的假根组成。柄部较短，下部呈圆柱形，上部扁压。叶片光滑，全缘，但具有波状褶皱，单室孢子囊群位于成熟藻体叶片表面。
2、螺旋藻
螺旋藻又称为蓝绿藻，藻丝体长μm，宽5-10μm，在显微镜下呈疏松或紧密的有规则的螺旋弯曲状，形如钟表发条而得名。蓝藻类细胞无色素体，色素分布在原生质体外部的色素区，蓝绿色。藻体表面不具胶质鞘，不易被微生物附着，细胞内有气泡，上浮性好。细胞或藻丝顶部常不尖细，横壁常不明显[52石斛网www.52shihu.com]，顶细胞圆形，外壁不增厚。
三、生境与分布不同
1、海带
海带生于海边低潮线下2m深度的岩石上，人工养殖生长在绳索或竹材上。主要分布于千岛群岛、萨哈林岛和日本的北海道，美洲太平洋和大西洋北岸。中国只有海带1种。主要产于辽东半岛和山东半岛沿岸。
2、螺旋藻
螺旋藻喜高温（25-30℃），高碱（）的特性，因此它可以聚集生活在较严酷的环境中，如碱水湖、一些海洋环境和盐碱湖（主要的生长地）。主要分布于热带、亚热带地区淡水及盐碱性湖泊中，自然环境中。螺旋藻主要分布于中非乍得湖、墨西哥特西科科湖和我国云南永胜程海湖。